Na wyspie Phu Quoc występują dwa wyraźne sezony. Pora sucha trwa od listopada do kwietnia, z temperaturami dziennymi w granicach 25–32°C, niską wilgotnością i minimalną ilością opadów, co sprzyja plażowaniu i aktywnościom na świeżym powietrzu. Najchłodniejszym miesiącem jest styczeń ze średnią temperaturą 27,4°C, natomiast najcieplejszymi są kwiecień i maj, kiedy temperatura może sięgać nawet 35–36°C.
Pora deszczowa przypada na okres od maja do października i charakteryzuje się częstymi, intensywnymi opadami i wysoką wilgotnością powietrza sięgającą 85–90%. Temperatura wody jest przyjemna przez cały rok i waha się między 27,5°C w styczniu a 30,5°C w maju. Roczna suma opadów jest bardzo wysoka i wynosi około 3030 mm, przy czym najbardziej deszczowym miesiącem jest sierpień.